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Gene id | 84171 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Summary SNPs Protein Summary Gene ontology KEGG pathways Diseases PubMed references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Summary |
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Gene Symbol | LOXL4 Gene UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aliases | LOXC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene name | lysyl oxidase like 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternate names | lysyl oxidase homolog 4, lysyl oxidase related C, lysyl oxidase-like 4 pseudogene, lysyl oxidase-like protein 4, lysyl oxidase-related protein C, | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene location |
10q24.2 (98268249: 98247685) Exons: 16 NC_000010.11 |
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Gene summary(Entrez) |
This gene encodes a member of the lysyl oxidase gene family. The prototypic member of the family is essential to the biogenesis of connective tissue, encoding an extracellular copper-dependent amine oxidase that catalyses the first step in the formation of crosslinks in collagens and elastin. A highly conserved amino acid sequence at the C-terminus end appears to be sufficient for amine oxidase activity, suggesting that each family member may retain this function. The N-terminus is poorly conserved and may impart additional roles in developmental regulation, senescence, tumor suppression, cell growth control, and chemotaxis to each member of the family. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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OMIM | 607318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs |
rs17524355 Strand: Allele origin: Allele change: C/T Mutation type: snp CM000672.2 g.98253681C>T NC_000010.10 g.100013438C>T NC_000010.11 g.98253681C>T NM_032211.6 c.1707G>A NP_115587.6 p.Ala569= XP_005270273.1 p.Ala570= XP_006718083.1 p.Ala570= XR_246174.1 n.487+1479C>T rs737657 Strand: Allele origin: Allele change: A/G Mutation type: snp CM000672.2 g.98253133A>G NC_000010.10 g.100012890A>G NC_000010.11 g.98253133A>G NM_032211.6 c.1835+420T>C XR_246174.1 n.487+931A>G |
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Protein Summary |
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Protein general information | Q96JB6 Name: Lysyl oxidase homolog 4 (EC 1.4.3. ) (Lysyl oxidase like protein 4) (Lysyl oxidase related protein C) Length: 756 Mass: 84,483 Tissue specificity: Expressed in many tissues, the highest levels among the tissues studied being in the skeletal muscle, testis and pancreas. Expressed in cartilage. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
MAWSPPATLFLFLLLLGQPPPSRPQSLGTTKLRLVGPESKPEEGRLEVLHQGQWGTVCDDNFAIQEATVACRQLG FEAALTWAHSAKYGQGEGPIWLDNVRCVGTESSLDQCGSNGWGVSDCSHSEDVGVICHPRRHRGYLSETVSNALG PQGRRLEEVRLKPILASAKQHSPVTEGAVEVKYEGHWRQVCDQGWTMNNSRVVCGMLGFPSEVPVDSHYYRKVWD LKMRDPKSRLKSLTNKNSFWIHQVTCLGTEPHMANCQVQVAPARGKLRPACPGGMHAVVSCVAGPHFRPPKTKPQ RKGSWAEEPRVRLRSGAQVGEGRVEVLMNRQWGTVCDHRWNLISASVVCRQLGFGSAREALFGARLGQGLGPIHL SEVRCRGYERTLSDCPALEGSQNGCQHENDAAVRCNVPNMGFQNQVRLAGGRIPEEGLLEVQVEVNGVPRWGSVC SENWGLTEAMVACRQLGLGFAIHAYKETWFWSGTPRAQEVVMSGVRCSGTELALQQCQRHGPVHCSHGGGRFLAG VSCMDSAPDLVMNAQLVQETAYLEDRPLSQLYCAHEENCLSKSADHMDWPYGYRRLLRFSTQIYNLGRTDFRPKT GRDSWVWHQCHRHYHSIEVFTHYDLLTLNGSKVAEGHKASFCLEDTNCPTGLQRRYACANFGEQGVTVGCWDTYR HDIDCQWVDITDVGPGNYIFQVIVNPHYEVAESDFSNNMLQCRCKYDGHRVWLHNCHTGNSYPANAELSLEQEQR LRNNLI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural information |
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Other Databases | GeneCards: LOXL4;  Malacards: LOXL4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene ontology |
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Diseases
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PubMed references |
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