Search Result
Gene id | 2018 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Gene Summary SNPs Protein Summary Gene ontology KEGG pathways Diseases PubMed references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Summary |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | EMX2 Gene UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene name | empty spiracles homeobox 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternate names | homeobox protein EMX2, empty spiracles homolog 2, empty spiracles-like protein 2, | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene location |
10q26.11 (117542444: 117549545) Exons: 3 NC_000010.11 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene summary(Entrez) |
This gene encodes a homeobox-containing transcription factor that is the homolog to the 'empty spiracles' gene in Drosophila. Research on this gene in humans has focused on its expression in three tissues: dorsal telencephalon, olfactory neuroepithelium, and urogenetial system. It is expressed in the dorsal telencephalon during development in a low rostral-lateral to high caudal-medial gradient and is proposed to pattern the neocortex into defined functional areas. It is also expressed in embryonic and adult olfactory neuroepithelia where it complexes with eukaryotic translation initiation factor 4E (eIF4E) and possibly regulates mRNA transport or translation. In the developing urogenital system, it is expressed in epithelial tissues and is negatively regulated by HOXA10. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct proteins.[provided by RefSeq, Sep 2009] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 600035 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs |
rs1638626 Strand: Allele origin: Allele change: A/G Mutation type: snp CM000672.2 g.117541943C>T NC_000010.10 g.119301454C>T NC_000010.11 g.117541943C>T NG_013009.1 g.4499C>T NM_001165924.1 c.-1325C>T NM_004098.3 c.-1325C>T NR_002791.2 n.574+2363G>A NR_144378.1 n.493+154G>A rs2240776 Strand: Allele origin: Allele change: A/C/T Mutation type: snp CM000672.2 g.117548013T>A CM000672.2 g.117548013T>G NC_000010.10 g.119307524T>A NC_000010.11 g.117548013T>A NC_000010.11 g.117548013T>G NG_013009.1 g.10569T>A NG_013009.1 g.10569T>G NM_001165924.1 c.407-52T>A NM_001165924.1 c.407-52T>G NM_004098.3 c.592-52T>A NM_004098.3 c.592-52T>G rs2286629 Strand: Allele origin: Allele change: A/C Mutation type: snp CM000672.2 g.117542183T>G NC_000010.10 g.119301694T>G NC_000010.11 g.117542183T>G NG_013009.1 g.4739T>G NM_001165924.1 c.-1085T>G NM_004098.3 c.-1085T>G NR_002791.2 n.574+2123A>C NR_144378.1 n.407A>C rs365446 Strand: Allele origin: Allele change: C/G Mutation type: snp CM000672.2 g.117544804G>C NC_000010.10 g.119304315G>C NC_000010.11 g.117544804G>C NG_013009.1 g.7360G>C NM_001165924.1 c.406+1131G>C NM_004098.3 c.407-828G>C NR_002791.2 n.265C>G rs385209 Strand: Allele origin: Allele change: A/C/G Mutation type: snp CM000672.2 g.117544545T>C CM000672.2 g.117544545T>G NC_000010.10 g.119304056T>C NC_000010.11 g.117544545T>C NC_000010.11 g.117544545T>G NG_013009.1 g.7101T>C NG_013009.1 g.7101T>G NM_001165924.1 c.406+872T>C NM_001165924.1 c.406+872T>G NM_004098.3 c.406+872T>C NM_004098.3 c.406+872T>G NR_002791.2 n.503+21A>C NR_002791.2 n.503+21A>G NR_144378.1 n.-1956A>C NR_144378.1 n.-1956A>G rs703411 Strand: Allele origin: Allele change: A/G Mutation type: snp CM000672.2 g.117541071C>T NC_000010.10 g.119300582C>T NC_000010.11 g.117541071C>T NG_013009.1 g.3627C>T NM_001165924.1 c.-2197C>T NM_004098.3 c.-2197C>T NR_002791.2 n.574+3235G>A NR_144378.1 n.493+1026G>A rs740734 Strand: Allele origin: Allele change: C/G Mutation type: snp CM000672.2 g.117547867G>C NC_000010.10 g.119307378G>C NC_000010.11 g.117547867G>C NG_013009.1 g.10423G>C NM_001165924.1 c.407-198G>C NM_004098.3 c.592-198G>C rs8192640 Strand: Allele origin: Allele change: C/T Mutation type: snp CM000672.2 g.117545494C>T NC_000010.10 g.119305005C>T NC_000010.11 g.117545494C>T NG_013009.1 g.8050C>T NM_001165924.1 c.406+1821C>T NM_004098.3 c.407-138C>T NR_002791.2 n.-426G>A rs855768 Strand: Allele origin: Allele change: C/T Mutation type: snp CM000672.2 g.117547956G>A NC_000010.10 g.119307467G>A NC_000010.11 g.117547956G>A NG_013009.1 g.10512G>A NM_001165924.1 c.407-109G>A NM_004098.3 c.592-109G>A rs855769 Strand: Allele origin: Allele change: C/T Mutation type: snp CM000672.2 g.117544585A>G NC_000010.10 g.119304096A>G NC_000010.11 g.117544585A>G NG_013009.1 g.7141A>G NM_001165924.1 c.406+912A>G NM_004098.3 c.406+912A>G NR_002791.2 n.484T>C NR_144378.1 n.-1996T>C |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Summary |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein general information | Q04743 Name: Homeobox protein EMX2 (Empty spiracles homolog 2) (Empty spiracles like protein 2) Length: 252 Mass: 28,303 Tissue specificity: Cerebral cortex. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
MFQPAPKRCFTIESLVAKDSPLPASRSEDPIRPAALSYANSSPINPFLNGFHSAAAAAAGRGVYSNPDLVFAEAV SHPPNPAVPVHPVPPPHALAAHPLPSSHSPHPLFASQQRDPSTFYPWLIHRYRYLGHRFQGNDTSPESFLLHNAL ARKPKRIRTAFSPSQLLRLEHAFEKNHYVVGAERKQLAHSLSLTETQVKVWFQNRRTKFKRQKLEEEGSDSQQKK KGTHHINRWRIATKQASPEEIDVTSDD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural information |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Databases | GeneCards: EMX2;  Malacards: EMX2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene ontology |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Diseases
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubMed references |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|